環境DNAデータ解析受託/判別用データベースおよびスクリプト作成
環境DNA解析は、使用するデータベースや生物種の割り当て手法の選択により、判別結果が異なる可能性があります。
弊社では生物種毎のキュレーション済みDNAデータベース作成や、生物種のアノテーション方法を最適化しており、実験目的に応じた判別結果をご提供します。
サービス項目
| ① データ再解析 | お手持ちのDNAデータを再解析し、生物種のアノテーションまで行います。 |
| ②判別用データベース構築 | NCBI等から最新のデータに基づいた判別用データベースを作成します(判別領域毎 rbcL/ITS/Co1など)。Qiime2,Blast検索にご利用頂けます。 |
| ③前処理〜アノテーションまでのコードの作成 | fastqファイルの取り込みから生物種アノテーションまでのコードを作成します。ご希望のパラメーターや手順があれば対応致します。 |
| ④下流解析 | 出力されたbamファイル等から、主成分分析等の下流解析を行います。 |
| ⑤解析環境の構築 | クラウドサービス(Azure)を使用し解析用のLinux環境を構築します。仮想マシンの立ち上げ、リモートデスクトップ環境の構築、主要アプリケーションのインストールまで行います。インフラ投資の初期費用を大幅に抑えて解析業務をスタートすることができます。(お客様自身で別途クラウドサービスのご契約が必要です) |

